Ptolemaeus Eupator was de zoon van Ptolemaeus VI Philometor en Cleopatra II en regeerde korte tijd in 152 v. Chr. als medeheerser op Cyprus met zijn vader.
Er wordt gedacht dat Ptolemaeus Eupator in augustus van datzelfde jaar stierf.
Eupator wordt bevestigd op een klein aantal documenten en inscripties: hij wordt genoemd in een demotische papyrus in het bezit van het British Museum, er wordt naar verwezen als een priester van de cultus van Alexander tijdens 158-157 v. Chr. en dat hij een co-regent was met zijn vader in 152 v. Chr., Eupator was waarschijnlijk 12 of 13 jaar oud toen hij stierf.
Hij verschijnt ook in een lijst van vergoddelijkte Ptolemaeën.